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计算生物学课题组

  • 发布于 2016-10-01
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生物大分子的结构及其构象的变化是了解其功能和活性的基础,计算机模拟可以和实验结合更好的解释各种生物分子的作用机制和规律。本课题组的研究工作主要基于物理与化学原理,应用理论和计算机模拟方法研究生物大分子构象变化和功能机制的关系,包括蛋白质折叠,错误折叠与聚集的机制;蛋白质翻译过程中核糖体上相关延长因子的转位作用机制,核酸与小分子的相互作用等等。

研究方向: 生物大分子结构相关的计算机模拟

课题组负责人:张竹青

课题组成员:王漠野  胡杰  欧阳艳华

代表性研究成果(近五年发表文章):

1. Zhuqing Zhang, and Hue Sun Chan. "Transition paths, diffusive processes, and preequilibria of protein folding".  Proc Natl Acad Sci U S A. 2012: 109: 20919-20924
2. Zarrine-Afsar* A., Zhang* Z., Schweiker KL., Makhatadze GI., Davidson AR. and Chan HS. “Kinetic Consequences of Native State Optimization of Surface-Exposed Electrostatic Interactions in the Fyn SH3 Domain”. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics (2012) 80: 858-870 (*equal contribution) 
3. Hue Sun Chan, Zhuqing Zhang, Stefan Wallin and Zhirong Liu. “Native Topology, Local-Nonlocal Coupling, and Nonnative Interactions: Principles of Protein Folding from Coarse-Grained Models”. Annu Rew Phys Chem. 2011: 62: 301-32 
4. Zhuqing Zhang, and Hue Sun Chan. “Competition between Native Topology and Nonnative Interactions in Simple and Complex Folding Kinetics of Natural and Designed Proteins”. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010: 107: 2920–2925