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生命学院张竹青课题组发布首个蛋白质体外液液相分离数据库

  • 王洁婷
  • 发布于 2019-09-12
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近年来,蛋白质液液相分离(Liquid-liquid Phase Separation, LLPS)逐渐成为生物学研究的热点之一。它在生命体的正常代谢和疾病过程中都发挥着非常重要的作用。随着越来越多的探索LLPS具体发生机制的报道,人们发现影响蛋白质LLPS的因素主要来自于两个方面:一是蛋白质序列性质,如突变及翻译后修饰的影响;二是受到体系微环境,比如温度、蛋白质浓度、pH值、盐浓度、压力等的调节。生命学院张竹青课题组收集了目前文献报道过的所有能在体外发生LLPS的蛋白质及其相分离相关实验条件,经过系统的分类整理和注释,发布了目前首个专门研究蛋白质体外LLPS的数据库(Liquid-liquid phase separation database, LLPSDB)。通过网站(http://bio-comp.ucas.ac.cn/llpsdb or http://bio-comp.org.cn/llpsdb),用户可以对数据库进行浏览、查询和下载。文章“LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro”于201996日在国际著名期刊Nucleic Acids ResearchIF=11.147)上在线发表(https://doi.org/10.1093/nar/gkz778)。生命学院硕士生李倩和彭小珺为论文共同第一作者,2016级本科生李源清、唐文勤和朱家安参与了部分工作,张竹青副教授为论文通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金和中国科学院大学青年教师提升项目的支持。

095621 817380.2

LLPSDB的数据结构