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生命学院513班小讲堂:基因组装的算法与策略

  • 日期:2016-12-06
  • 3300

1028日晚,国科大生命学院513班主办研究生学术讲座研讨会在教一205举行,本次讲座由来自华大基因的翁建聪同学主讲,他与大家分享的主题是《基因组装的算法与策略》。

认真讲解的翁建聪同学认真讲解的翁建聪同学

翁建聪从概念出发,运用风趣的措辞向大家介绍了基因组装的概念及原理。基因组装就是把测序下的短序列根据他们之间的重叠关系将序列尽可能地延长,其目的是得到全基因的序列。他介绍了两个关于组装的算法,分别是一代测序技术中的OLC 算法和用于二代测序技术的DBG 算法,以及在序列组装中起重要作用的欧拉图路径(Eulerian Cycle)进行了说明。

和谐的小讲堂全景和谐的小讲堂全景

翁建聪同学阐述了基因组装的一般流程,并详细介绍了影响基因组装的4个因素:测序错误、重复序列、物种杂合度、样品污染程度。最后,他对评估基因组装的好否的指标做了详细说明。讲课过程中不少同学对于本次讲堂的主题表现出很大的兴趣,纷纷提出问题,而翁建聪同学对此都能一一作答,得到了同学们都认可。

认真学习的同学们认真学习的同学们

翁建聪同学以广东普通话及通俗易懂的解说,为正常学术活动增添了不少活力,同学们都学得很快乐,正所谓"寓教于乐"。在感叹主讲同学深厚专业知识功底的同时,你我是否都想到了"路漫漫其修远兮,吾将上下而求索",未来还长,让我们一起努力吧!

大合照。很多其它班的同学太害羞,没有参与我们的合影大合照。很多其它班的同学太害羞,没有参与我们的合影

花絮

小讲堂结束后小讲堂结束后

生命学院513班小讲堂开讲以来受到生命学院同学们广泛的支持和关注,在此513班表示感谢,为了让更多"有志之士"加入我们,小讲堂创始人张鹏帆同学创建了QQ群(群号:596825369),共享每次活动的PPT,欢迎用"班级+所名称+姓名"的方式通过验证加入,513班欢迎你,谢谢各位!

下期预告:时间:2016115日(周六),晚上630

          地点:教一205

          主讲人:张亚洲(昆明植物研究所)

          主题:中国被子植物科属概述